熔盐泵的使用中，但凡有任何小的问题都不能继续工作。如果熔盐泵轴的填料完全磨损了要及时添加，如果继续使用熔盐泵则会漏气。后果会使电机耗能增加进而损坏叶轮。熔盐泵使用后切记要注意保养，熔盐泵用完后要把熔盐泵里的水放干净，把水管卸下来然后用清水冲洗。如果熔盐泵在使用过程中发生强烈的震动，一定要停车检查具体原因，否则同样会对水泵造成损坏。熔盐泵上的胶带也要卸下来，然后用水冲洗干净后在光照处晾干，不要把胶带放在阴暗潮湿的地方。水泵的胶带一定不能沾上油污，更不要在胶带上涂一些带粘性的东西。
当熔盐泵底阀漏水时，千万不要盲目的用干土填入到水泵进口管里，用水冲到底阀处，这样的做法实在不可取。因为当把干土放入到进水管里，当水泵开始工作时这些干土会进入泵内，损坏水泵叶轮和轴承，这样做大大缩短了水泵的使用寿命。当底阀漏水时一定要重视及时维修，如果损坏严重需及时更换新泵。熔盐泵和管道的接口处一定要做好密封，因为如果有杂物进入的话都会对水泵内部造成损坏。泵上的轴承也在重点检查范围内，用完后检查轴承是否有磨损，如果水泵用的时间长的话轴承里的小滚珠会碎。所以当水泵用过后在轴承上涂一层润滑油更好的保护水泵轴承。